Od czasu wielkiej powodzi na Odrze w 1997 roku kraj związkowy Brandenburgia zainwestował ponad 658 milionów euro w ochronę przeciwpowodziową. Odnowiono lub zbudowano od podstaw ponad 267 kilometrów wałów przeciwpowodziowych. „Dzięki tym inwestycjom w ochronę przeciwpowodziową Brandenburgia będzie w przyszłości znacznie lepiej chroniona niż w przeszłości“ powiedział 11 kwietnia w brandenburskim Landtagu minister ochrony środowiska Jörg Vogelsänger.
Przez Brandenburgię przepływają wzdłuż granicy z Polską Odra i Nysa Łużycka oraz Hawela i Szprewa z dopływami.